实事求是 清查“两案”遗留问题
清查同林彪、“四人帮”反革命集团有牵连的人和事，是另一种性质的历史遗留问题。粉碎“四人帮”后，广东的清查工作虽然花费了很大精力，也是有成绩的，但在十一届三中全会彻底否定“文化大革命”以前，难以取得完全胜利。省委认为，要克服松劲情绪，善始善终地把清查工作搞彻底。
省委对清查工作抓得比较紧，但对“两案”的定性、处理比较慢。这有两方面原因，一是省委工作确实太忙；二是认为慢处理比快处理要稳妥些，匆忙定性、处理，可能有一些案子到后来还要返工。当时，有一些同志批评省委缺乏勇气，处理问题不果断。杨尚昆虽然认为这种批评有一定道理，但也主张不能凭感情，不能重复过去“四人帮”整老干部“残酷斗争、无情打击”的做法，要恢复正确开展党内斗争的优良传统。省委坚决执行中央关于“两案”问题定性处理原则的精神，对广东“两案”的具体情况进行了具体分析，不完全套条文、抠文字，而是用每个案子的材料实事求是地去对照中央的政策原则，该是什么性质就定什么性质。同时，还要考虑到两个方面：一要考虑群众影响，某个案子处理下来，群众同意不同意，是不是拥护；二要考虑本人的态度，是不是认识错误，是不是有悔改表现。要做犯错误同志的思想转化工作，这也有两个方面，一是教育他本人，确有悔改表现；二是确有悔改表现才能得到群众谅解。在处理广东几起较大案件中，省委内部是有争论的，但是省委始终坚持实事求是，处理的案子经受了历史考验。所以这项工作拖得时间比较长，到1980年下半年才基本结束。
调动干部积极性 注重培养地方干部
实现党的工作重点转移，集中精力探索、开辟一条改革开放新路，必须团结广大干部，首先是基层干部，解除他们身上的精神枷锁，调动起他们最大的积极性。1979年2月7日，杨尚昆在佛山地委扩大会议上讲话时强调，要认真贯彻十一届三中全会精神，保护基层干部，把农业生产搞上去。他说：“基层干部，包括县委的同志在内，应该讲是最辛苦的。我在中央工作的时候就是这样认识的。‘上面千条线，下面一根针’，所有的事情都要通过县、公社、大队、生产队。他们确实是风里来雨里去，大多数同志是想把工作搞好，把生产搞上去的。当然，有错误应当批评，但对公社以下的基层干部应该以讲道理为主，以表扬鼓励为主，同情他们的疾苦，了解他们的困难，保护和发挥他们的积极性。当然，也有少数不好的，违法乱纪、贪污腐化，但这只是极少数。只要不是反革命，又不是刑事犯，对他们都应该惩前毖后，治病救人，多做思想工作，少处分，更不要动辄开除党籍、撤职。总之，我们要关心干部的疾苦，基层干部有很大功劳。‘文化大革命’最乱的几年，他们还在工作嘛。过去许多政策是中央定的，省委定的，出了毛病责任在中央，在省委。下边的同志辛辛苦苦地工作，是没有责任的，运动一来，什么问题都扣到他们头上，是不公平的。这个问题我们的县委要认真讨论，要保护基层干部的积极性，只要他们在勤勤恳恳地工作，就要多体谅，多鼓励。过去批评不当的，县委要主动承担责任。当然，对个别坏人要进行严肃处理。对那些‘造反派’、搞帮派活动的人，有的问题很严重，有的是跟着人家走，这些都要分清楚，分别对待。要坚持实事求是。”
杨尚昆到广东后，首先面临调整各级领导班子问题。领导班子不调整，局面打不开，贯彻十一届三中全会精神就是一句空话。调整、整顿领导班子，不是只调整一两个人，也不是干部大换班，而是组建一个能联系群众，真正成为带领本地区、本部门广大干部群众建设社会主义的坚强集体。在杨尚昆兼任广州市职务以前，市委已经有了一个调整方案。杨尚昆到职后，由于对干部情况缺乏了解，就提出调整领导班子的工作向后略微推迟，熟悉一下干部情况再定。这个意见经市委常委讨论一致同意。但是，很多干部职务未定，一些工作无法落实。有人议论说，你这个第一书记来了可以推翻以前的决定，将来再来一位书记也可以推翻你的决定，那不是永远解决不了问题吗？对此，杨尚昆解释说，“这不是‘长官意志’、‘一言堂’，是经过市委讨论同意的。假如明天把我调走了，后天来了一个张书记、王书记，他觉得杨某人在这里经市委同意的部分干部安排的不妥，要改变，提请市委讨论，这也是正常的。我声明，我到广东来，没有带一个干部，是‘光杆’来的，我的班子就是你们大家。现在市委工作的同志就是我的班子。”1979年6月，杨尚昆在市委三届二次常委扩大会议上宣布，调整和整顿领导班子的工作要继续抓紧进行。在调整和整顿过程中，要以思想整顿为主，在对“文化大革命”中犯有打砸抢错误、整过人，现仍居领导岗位，群众有意见的人，要分别情况进行处理，最低限度要作自我检讨，登门道歉，主动承认并自觉改正错误。对老干部要作妥善安置，组织部门要做好这方面的工作。
当时，广东的干部同全国一样，年龄老化。省直机关部、委、办、局以上干部中，56岁以上的占71％，11个地、市委常委，平均年龄55.8岁，56岁以上的占53％，不少老同志带病坚持工作。因为“文化大革命”耽误了十多年，恨不得一天就把十年的损失弥补上，快快实现四个现代化。你劝他休息，少做点工作，他还不高兴。但是，毕竟年龄不饶人，培养接班人问题迫在眉睫。对培养接班人，杨尚昆主张“台阶论”，就是说，得有点经历、经验。比如说，一个好的农村支部书记，一下子提为省委第一书记，是不可能的，因为他缺乏管理全省的经验和水平。接班人不但要品质好，作风正派，党性强，身体健康，还要有一定的工作能力和组织领导水平。同时，对接班人还要坚持不断地帮助、教育，使他们继续得到提高。杨尚昆强调，“这是我们全党当然也是广东省的头等任务。”杨尚昆在广东工作两年，出面讲话最多的是在组织部、纪检委和党校，不外是因为这些部门的工作直接关系着整顿党风，恢复党的优良传统，培养合格的接班人，建设一支坚强的干部队伍的问题。
在广东，由于历史原因，在各级领导班子中，新中国成立前后随军南下的干部占很大比重，大量培养地方干部，帮助他们迅速成长，是省委的一项重要任务。因为他们更熟悉情况，更便于联系群众。但是，在这个问题上人们的认识也不完全一致。1979年夏，叶剑英在广州接见省三级干部会议的同志时即席讲话，勉励大家同心协力把广东的工作搞上去，强调上下之间、地方干部和外来干部之间要加强团结，希望外来干部要在广东扎下根来，同时又希望本地干部迅速成长。不料，短短几句很好的话却引起轩然大波。一是讲外地干部要在广东扎下根时，只提到习仲勋，没有提杨尚昆，于是就有谣传说你别看杨某人如何如何，他在这里长不了。一是叶剑英在讲话时问今天来了多少地方干部，地方干部请举手！他看到举手的人很多，表示非常高兴。于是就有人跑到杨尚昆办公室，说叶帅又搞地方主义了。这些造谣的人不懂得，要求外来干部在广东扎下根来，并不是说外来干部到了广东就一辈子不能调动了，而是说外来干部应该全心全意把工作搞好，更重要的是带出一批干部，教会他们怎样工作，有了接班人，这才是真正扎下了根。不培养地方干部，什么都要自己去干，一直干到老、干到死，也还是没有生根。
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